Master thesis/ Masterarbeit
Identification of hybridization events in the evolution of Aeonium (Crassulaceae)
Next-Generation-Sequencing (NGS) based phylogenetic studies of the predominantly Macaronesian genus Aeonium (Crassulaceae) have shown that some of the lineages within Aeonium are recovered in different positions of the phylogenetic tree, depending on the sequence dataset and analysis method deployed. One of the reasons for this kind of supported phylogenetic conflict may be past hybridization events that can happen over the course of evolution. A potential Master thesis project will investigate whether selected lineages and species of Aeonium may be the product of a past hybridization event. To this end, sequence data from a ddRADseq (double-digest restriction-site associated DNA sequencing) experiment already at hand as well as newly sequenced high-copy regions of the nuclear genome of the sampled plants (e.g., ITS) will be analyzed.
Identifikation von Hybridisierungsereignissen in der Evolution von Aeonium (Crassulaceae)
Next-Generation-Sequencing-basierte phylogenetische Untersuchungen an der vornehmlich makaronesisch verbreiteten Gattung Aeonium (Crassulaceae) haben gezeigt, dass manche Abstammungslinien innerhalb von Aeonium je nach zugrunde gelegten Sequenzdatensatz und Analysemethode unterschiedliche Positionen im Stammbaum einnehmen. Die Ursache für eine solche unterstützte phylogenetische Inkonsistenz können unter anderem vergangene Hybridisierungsereignisse im Laufe der Evolution sein. Im Rahmen einer Master-Abschlussarbeit kann für ausgewählte Abstammungslinien und Arten von Aeonium untersucht werden, ob sie das Produkt eines Hybridisierungsereignisses darstellen. Dafür werden sowohl bereits vorhandene Sequenzdaten aus einem ddRAD-Seq-Experiment (double-digest restriction-site associated DNA sequencing) verwendet, als auch neu zu sequenzierende Regionen aus dem Kerngenom der untersuchten Pflanzen (z.B. ITS), die dort in hoher Kopienzahl vorliegen.
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Arbeitsort/Place of work: Nymphenburg